一、党委办公室(校长办公室、外事办公室)
二、中共新疆师范高等专科学校(新疆教育学院)纪律检查委员会(自治区监察委员会驻新疆师范高等专科学校(新疆教育学院)监察专员办公室、中共新疆师范高等专科学校(新疆教育学院)委员会巡察工作领导小组办公室)
三、党委组织人事部
四、党委统一战线工作部
五、党委宣传部
六、党委教师工作部
七、党委学生工作部(武装部)
八、团 委
九、工 会
十、教务处
十一、科研处
十二、发展规划处
十三、财务处
十四、审计处
十五、保卫处
十六、国有资产管理处
十七、培训处(中小学教师继续教育中心)